踏んだり蹴ったりですね。

玄箱の利用用途の一つに2chブラウザのrep2があるのですが、いつの間にかiPhone用の表示にも対応したみたいなので、試しにアップグレードしてみたところ、PHP 5のバージョンが古いと怒られ表示できなくなりました。

そこで、Debianをetchからlennyにしようと思って

[/var/apt/sources.list]
deb http://ftp.jp.debian.org/debian lenny main contrib non-free
deb http://security.debian.org lenny/updates main contrib non-free

と書き換えたました。

が、dist-upgradeを使わずに、普通に

sudo aptitude update
sudo aptitude upgrade

を使ったのはよかったのだろうか？

とりあえず、それから

sudo aptitude install php5

とやったらphp 5の5.2.6が入ったので、そこまではめでたしめでたしだった訳です。

でも、iPhoneから見に行くと（もはやメッセージを失念してしまいましたが、UserAgentがsoftbankかどうか云々という関数が見つからないというようなものでした）pearが古いために起こるのではないかと思われるエラーが出てみられません。

そこで今度はpearを

sudo aptitude install pear

とやったのが運の尽き？

まず（なぜか）sambaがアップデートされようとしたものの不可能で、途中で終了。
そこでググってみたところ、こんなのがヒットしたので、ここに書かれているように（正直まったくわかっていないでやっている）

sudo aptitude install update-inetd

とやると、なにやらたくさんのものが削除されそうになる（Apacheやらなんやら）。

Yで先に進んだけれどもそれはさすがにまずいと思って、Ctrl-cで途中で辞めたら、今度はaptitudeが「入手先一覧のディレクトリがロックできません…rootになっていますか?」というメッセージを表示しおかしくなりました。

ファイルがロックされているらしいので、試しに再起動してみるかと思ってrebootしたら、起動できなくなりました・・・。

これはもういよいよAtomサーバーを購入しろというお告げかな？

我が家では玄箱のUSBポートにBrotherのレーザープリンタHL-1440をさして、CUPSを使ってプリンタサーバーとして利用もしています。

これの良いところはRAWモードにしておけばドライバはそのクライアントOSそのもののが使えるということ。

が、今日印刷しようと思ったらできていませんでした。

おかしいなぁと思っていると、CUPSがプリンタ自身を認識していない模様。

"usb:/dev/usblp0": No such device"

なんておっしゃる。
CUPSのプリンタの変更を押しても以前ならば、デバイスの選択画面でUSB Printer #1 (Brother HL-1440 Series)みたいにプリンタ名が表示されたように思えるのですが、表示されず。

仕方がないのでまずはdmesg

usb 3-1: new full speed USB device using ohci_hcd and address 6
usb 3-1: configuration #1 chosen from 1 choice

どうやら差されたことは認識しているよう。
次は、lsusb

Bus 003 Device 006: ID 04f9:000d Brother Industries, Ltd HL-1440 Laser Printer
Bus 003 Device 001: ID 1d6b:0001
Bus 002 Device 001: ID 1d6b:0001
Bus 001 Device 001: ID 1d6b:0002

こちらもOK。
おつぎはlsmod。

Module                  Size  Used by

何も表示されない。
usb関係のものは何かあるのか知らんと思って

/sbin/modinfo

でタブキーを押して選択肢を表示させるとusblpとかいうそれっぽい名前のやつが。
スーパーユーザーになって

insmod /lib/modules/2.6.25.1-kuroboxHG/kernel/drivers/usb/class/usblp.ko
/etc/init.d/cupsys restart

としたところ、無事に上記デバイス選択の画面でプリンタ名も表示されるようになり復活。
どうやら、カーネルを2.6.25にした際に読み込まれなくなっていたようです。

とあるスーパーコンピュータで（適当に想像してください、SUSE Linuxで動いているそうです）、分子描画ソフトのPyMOLをコンパイルして使えるようにしてみました。やるべきことはそんなにないのですが、色々と詰まってしまってようやくできました。

流れとしてはこんな感じ。

1. subversionのインストール
2. python 2.5のインストール
3. Mesaのインストール
4. PyMOLのインストール

1. subversionのインストール

古いバージョンならばソースコードがtar.gzになっているものsourceforgeから落とせますが、最新の物はsubversionでないと落とせないようです。 1 subversionは色々と便利なので、インストールしました。

依存関係がいくつかあって、neonのバージョンは0.25.4じゃないとダメみたいです。そして、neonがないとhttpsからのダウンロードができませんでした。

2. python 2.5のインストール

これはそのまま

./configure  --prefix=/home/ユーザー名/local
make
make install

だけ。

3. Mesaのインストール

PyMOLはGLUTというOpenGL（3D描画のためのAPI）のフロントエンドライブラリ？を利用しているので、それが使えないとまずいです。

ということで、ここでGLUTをダウンロードして適当にコンパイルしてみるものの、後のPyMOLのコンパイルでちっともうまくいきません。PyMOLの./configureのオプションを見てみると、–enable-mesaなんて言うのがありますので、じゃあMesaをインストールしてみようと思ってみました。

MesaLib-7.0.3.tar.gzとMesaGLUT-7.0.3をダウンロードして、make

tar zxvf MesaLib-7.0.3.tar.gz
tar zxvf MesaGLUT-7.0.3
cd Mesa-7.0.3
make linux-x86-64

makeの後のオプションはただ単にmakeとだけやれば出てきます。適当な物を選択します。

これで、Mesa-7.0.3/lib64（もしくはlib）に

• libGL.so
• libGL.so.1.5.070003
• libGLU.so.1
• libGLw.so
• libGLw.so.1.0.0
• libOSMesa.so.6
• libglut.so
• libglut.so.3.7.1
• libGL.so.1
• libGLU.so
• libGLU.so.1.3.070003
• libGLw.so.1
• libOSMesa.so
• libOSMesa.so.6.5.3
• libglut.so.3

というファイルができたので、/home/ユーザー名/local/libにコピーしました。

4. PyMOLのインストール

svn co https://pymol.svn.sourceforge.net/svnroot/pymol/trunk/pymol pymol
cd pymol
python setup.py build
python setup.py install
python setup2.py install

起動してみたところ、16CPUを認識してるよと言っています。

それにしても、意気揚々とインストールしたのに描画がとんでもなく遅いです。どうもX Window Systemが遅そう。

1. 落とせるのはフリーバージョンのVersion 0.99だが、問題はないと思う [↩]